Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z262

Cldn6, Claudin-6, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn6Q9Z262 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn6Q9Z262 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms