Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Y4

Trip6, Thyroid receptor-interacting protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip6Q9Z1Y4 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trip6Q9Z1Y4 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trip6Q9Z1Y4 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trip6Q9Z1Y4 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Trip6Q9Z1Y4 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Trip6Q9Z1Y4 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trip6Q9Z1Y4 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trip6Q9Z1Y4 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Trip6Q9Z1Y4 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trip6Q9Z1Y4 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Trip6Q9Z1Y4 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Trip6Q9Z1Y4 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trip6Q9Z1Y4 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trip6Q9Z1Y4 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trip6Q9Z1Y4 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trip6Q9Z1Y4 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trip6Q9Z1Y4 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trip6Q9Z1Y4 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trip6Q9Z1Y4 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trip6Q9Z1Y4 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trip6Q9Z1Y4 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Trip6Q9Z1Y4 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trip6Q9Z1Y4 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trip6Q9Z1Y4 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trip6Q9Z1Y4 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trip6Q9Z1Y4 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trip6Q9Z1Y4 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trip6Q9Z1Y4 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trip6Q9Z1Y4 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trip6Q9Z1Y4 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trip6Q9Z1Y4 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trip6Q9Z1Y4 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trip6Q9Z1Y4 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trip6Q9Z1Y4 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trip6Q9Z1Y4 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trip6Q9Z1Y4 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trip6Q9Z1Y4 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Trip6Q9Z1Y4 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trip6Q9Z1Y4 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Trip6Q9Z1Y4 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trip6Q9Z1Y4 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trip6Q9Z1Y4 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trip6Q9Z1Y4 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trip6Q9Z1Y4 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trip6Q9Z1Y4 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trip6Q9Z1Y4 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trip6Q9Z1Y4 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trip6Q9Z1Y4 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trip6Q9Z1Y4 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trip6Q9Z1Y4 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trip6Q9Z1Y4 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trip6Q9Z1Y4 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trip6Q9Z1Y4 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trip6Q9Z1Y4 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trip6Q9Z1Y4 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trip6Q9Z1Y4 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trip6Q9Z1Y4 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trip6Q9Z1Y4 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trip6Q9Z1Y4 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trip6Q9Z1Y4 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trip6Q9Z1Y4 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trip6Q9Z1Y4 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trip6Q9Z1Y4 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trip6Q9Z1Y4 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Trip6Q9Z1Y4 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Trip6Q9Z1Y4 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Trip6Q9Z1Y4 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trip6Q9Z1Y4 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trip6Q9Z1Y4 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trip6Q9Z1Y4 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trip6Q9Z1Y4 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trip6Q9Z1Y4 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trip6Q9Z1Y4 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trip6Q9Z1Y4 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trip6Q9Z1Y4 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trip6Q9Z1Y4 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trip6Q9Z1Y4 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trip6Q9Z1Y4 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trip6Q9Z1Y4 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trip6Q9Z1Y4 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trip6Q9Z1Y4 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trip6Q9Z1Y4 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trip6Q9Z1Y4 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trip6Q9Z1Y4 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trip6Q9Z1Y4 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trip6Q9Z1Y4 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trip6Q9Z1Y4 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Trip6Q9Z1Y4 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trip6Q9Z1Y4 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trip6Q9Z1Y4 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trip6Q9Z1Y4 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trip6Q9Z1Y4 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trip6Q9Z1Y4 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trip6Q9Z1Y4 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trip6Q9Z1Y4 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trip6Q9Z1Y4 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trip6Q9Z1Y4 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Trip6Q9Z1Y4 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trip6Q9Z1Y4 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Trip6Q9Z1Y4 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms