Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S7

Cldn9, Claudin-9, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn9Q9Z0S7 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
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