Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV55

Vapa, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapaQ9WV55 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
VapaQ9WV55 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
VapaQ9WV55 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VapaQ9WV55 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VapaQ9WV55 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VapaQ9WV55 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VapaQ9WV55 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VapaQ9WV55 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VapaQ9WV55 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VapaQ9WV55 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
VapaQ9WV55 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
VapaQ9WV55 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VapaQ9WV55 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VapaQ9WV55 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VapaQ9WV55 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
VapaQ9WV55 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VapaQ9WV55 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VapaQ9WV55 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VapaQ9WV55 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VapaQ9WV55 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VapaQ9WV55 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VapaQ9WV55 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
VapaQ9WV55 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
VapaQ9WV55 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VapaQ9WV55 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VapaQ9WV55 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
VapaQ9WV55 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VapaQ9WV55 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VapaQ9WV55 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VapaQ9WV55 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VapaQ9WV55 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
VapaQ9WV55 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VapaQ9WV55 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VapaQ9WV55 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VapaQ9WV55 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VapaQ9WV55 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VapaQ9WV55 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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VapaQ9WV55 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VapaQ9WV55 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VapaQ9WV55 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VapaQ9WV55 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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VapaQ9WV55 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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VapaQ9WV55 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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VapaQ9WV55 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
VapaQ9WV55 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
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VapaQ9WV55 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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VapaQ9WV55 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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VapaQ9WV55 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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VapaQ9WV55 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VapaQ9WV55 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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VapaQ9WV55 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VapaQ9WV55 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
VapaQ9WV55 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VapaQ9WV55 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VapaQ9WV55 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VapaQ9WV55 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
VapaQ9WV55 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
VapaQ9WV55 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VapaQ9WV55 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
VapaQ9WV55 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VapaQ9WV55 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
VapaQ9WV55 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VapaQ9WV55 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VapaQ9WV55 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VapaQ9WV55 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VapaQ9WV55 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VapaQ9WV55 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VapaQ9WV55 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VapaQ9WV55 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VapaQ9WV55 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
VapaQ9WV55 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
VapaQ9WV55 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
VapaQ9WV55 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
VapaQ9WV55 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
VapaQ9WV55 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
VapaQ9WV55 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
VapaQ9WV55 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
VapaQ9WV55 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
VapaQ9WV55 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms