Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUZ7

Sh3bgr, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, mousemouse

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrQ9WUZ7 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh3bgrQ9WUZ7 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh3bgrQ9WUZ7 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh3bgrQ9WUZ7 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh3bgrQ9WUZ7 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh3bgrQ9WUZ7 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh3bgrQ9WUZ7 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh3bgrQ9WUZ7 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh3bgrQ9WUZ7 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh3bgrQ9WUZ7 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sh3bgrQ9WUZ7 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sh3bgrQ9WUZ7 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sh3bgrQ9WUZ7 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sh3bgrQ9WUZ7 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sh3bgrQ9WUZ7 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sh3bgrQ9WUZ7 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sh3bgrQ9WUZ7 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sh3bgrQ9WUZ7 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sh3bgrQ9WUZ7 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sh3bgrQ9WUZ7 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sh3bgrQ9WUZ7 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sh3bgrQ9WUZ7 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sh3bgrQ9WUZ7 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sh3bgrQ9WUZ7 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sh3bgrQ9WUZ7 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sh3bgrQ9WUZ7 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Sh3bgrQ9WUZ7 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Sh3bgrQ9WUZ7 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sh3bgrQ9WUZ7 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sh3bgrQ9WUZ7 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sh3bgrQ9WUZ7 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sh3bgrQ9WUZ7 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sh3bgrQ9WUZ7 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sh3bgrQ9WUZ7 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sh3bgrQ9WUZ7 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sh3bgrQ9WUZ7 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sh3bgrQ9WUZ7 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sh3bgrQ9WUZ7 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sh3bgrQ9WUZ7 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sh3bgrQ9WUZ7 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sh3bgrQ9WUZ7 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sh3bgrQ9WUZ7 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sh3bgrQ9WUZ7 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3bgrQ9WUZ7 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3bgrQ9WUZ7 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3bgrQ9WUZ7 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3bgrQ9WUZ7 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3bgrQ9WUZ7 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3bgrQ9WUZ7 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3bgrQ9WUZ7 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3bgrQ9WUZ7 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Sh3bgrQ9WUZ7 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3bgrQ9WUZ7 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
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Sh3bgrQ9WUZ7 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
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Sh3bgrQ9WUZ7 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Sh3bgrQ9WUZ7 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3bgrQ9WUZ7 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3bgrQ9WUZ7 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3bgrQ9WUZ7 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3bgrQ9WUZ7 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3bgrQ9WUZ7 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3bgrQ9WUZ7 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3bgrQ9WUZ7 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3bgrQ9WUZ7 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3bgrQ9WUZ7 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3bgrQ9WUZ7 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3bgrQ9WUZ7 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3bgrQ9WUZ7 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3bgrQ9WUZ7 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3bgrQ9WUZ7 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3bgrQ9WUZ7 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3bgrQ9WUZ7 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3bgrQ9WUZ7 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3bgrQ9WUZ7 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3bgrQ9WUZ7 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3bgrQ9WUZ7 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3bgrQ9WUZ7 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3bgrQ9WUZ7 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3bgrQ9WUZ7 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3bgrQ9WUZ7 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3bgrQ9WUZ7 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3bgrQ9WUZ7 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3bgrQ9WUZ7 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3bgrQ9WUZ7 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3bgrQ9WUZ7 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3bgrQ9WUZ7 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms