Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU78

Pdcd6ip, Programmed cell death 6-interacting protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd6ipQ9WU78 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC16■□□□□ 0.15
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Pdcd6ipQ9WU78 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdcd6ipQ9WU78 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdcd6ipQ9WU78 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdcd6ipQ9WU78 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdcd6ipQ9WU78 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pdcd6ipQ9WU78 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdcd6ipQ9WU78 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pdcd6ipQ9WU78 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdcd6ipQ9WU78 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdcd6ipQ9WU78 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdcd6ipQ9WU78 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdcd6ipQ9WU78 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdcd6ipQ9WU78 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Pdcd6ipQ9WU78 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdcd6ipQ9WU78 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pdcd6ipQ9WU78 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdcd6ipQ9WU78 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdcd6ipQ9WU78 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pdcd6ipQ9WU78 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pdcd6ipQ9WU78 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdcd6ipQ9WU78 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdcd6ipQ9WU78 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdcd6ipQ9WU78 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdcd6ipQ9WU78 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdcd6ipQ9WU78 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pdcd6ipQ9WU78 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdcd6ipQ9WU78 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Pdcd6ipQ9WU78 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdcd6ipQ9WU78 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdcd6ipQ9WU78 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdcd6ipQ9WU78 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdcd6ipQ9WU78 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdcd6ipQ9WU78 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdcd6ipQ9WU78 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdcd6ipQ9WU78 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdcd6ipQ9WU78 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Pdcd6ipQ9WU78 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdcd6ipQ9WU78 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdcd6ipQ9WU78 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdcd6ipQ9WU78 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdcd6ipQ9WU78 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Pdcd6ipQ9WU78 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdcd6ipQ9WU78 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdcd6ipQ9WU78 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdcd6ipQ9WU78 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdcd6ipQ9WU78 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Pdcd6ipQ9WU78 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdcd6ipQ9WU78 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdcd6ipQ9WU78 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdcd6ipQ9WU78 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Pdcd6ipQ9WU78 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdcd6ipQ9WU78 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Pdcd6ipQ9WU78 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdcd6ipQ9WU78 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Pdcd6ipQ9WU78 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdcd6ipQ9WU78 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdcd6ipQ9WU78 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdcd6ipQ9WU78 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdcd6ipQ9WU78 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdcd6ipQ9WU78 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdcd6ipQ9WU78 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Pdcd6ipQ9WU78 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdcd6ipQ9WU78 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdcd6ipQ9WU78 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdcd6ipQ9WU78 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdcd6ipQ9WU78 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdcd6ipQ9WU78 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdcd6ipQ9WU78 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdcd6ipQ9WU78 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdcd6ipQ9WU78 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdcd6ipQ9WU78 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdcd6ipQ9WU78 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdcd6ipQ9WU78 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdcd6ipQ9WU78 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdcd6ipQ9WU78 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdcd6ipQ9WU78 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdcd6ipQ9WU78 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdcd6ipQ9WU78 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdcd6ipQ9WU78 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms