Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU22

Ptpn4, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 4, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn4Q9WU22 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ptpn4Q9WU22 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ptpn4Q9WU22 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ptpn4Q9WU22 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ptpn4Q9WU22 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ptpn4Q9WU22 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ptpn4Q9WU22 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ptpn4Q9WU22 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ptpn4Q9WU22 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ptpn4Q9WU22 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ptpn4Q9WU22 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ptpn4Q9WU22 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ptpn4Q9WU22 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ptpn4Q9WU22 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ptpn4Q9WU22 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ptpn4Q9WU22 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ptpn4Q9WU22 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ptpn4Q9WU22 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptpn4Q9WU22 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms