Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P4

Psma1, Proteasome subunit alpha type-1, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma1Q9R1P4 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Psma1Q9R1P4 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Psma1Q9R1P4 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Psma1Q9R1P4 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Psma1Q9R1P4 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Psma1Q9R1P4 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Psma1Q9R1P4 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Psma1Q9R1P4 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Psma1Q9R1P4 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Psma1Q9R1P4 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Psma1Q9R1P4 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Psma1Q9R1P4 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Psma1Q9R1P4 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Psma1Q9R1P4 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Psma1Q9R1P4 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Psma1Q9R1P4 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Psma1Q9R1P4 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Psma1Q9R1P4 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Psma1Q9R1P4 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Psma1Q9R1P4 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Psma1Q9R1P4 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Psma1Q9R1P4 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Psma1Q9R1P4 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Psma1Q9R1P4 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Psma1Q9R1P4 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Psma1Q9R1P4 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Psma1Q9R1P4 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Psma1Q9R1P4 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Psma1Q9R1P4 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Psma1Q9R1P4 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Psma1Q9R1P4 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Psma1Q9R1P4 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Psma1Q9R1P4 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Psma1Q9R1P4 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Psma1Q9R1P4 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Psma1Q9R1P4 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Psma1Q9R1P4 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Psma1Q9R1P4 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Psma1Q9R1P4 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Psma1Q9R1P4 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Psma1Q9R1P4 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Psma1Q9R1P4 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Psma1Q9R1P4 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Psma1Q9R1P4 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Psma1Q9R1P4 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Psma1Q9R1P4 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Psma1Q9R1P4 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Psma1Q9R1P4 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Psma1Q9R1P4 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Psma1Q9R1P4 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Psma1Q9R1P4 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Psma1Q9R1P4 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Psma1Q9R1P4 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Psma1Q9R1P4 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Psma1Q9R1P4 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Psma1Q9R1P4 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Psma1Q9R1P4 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Psma1Q9R1P4 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Psma1Q9R1P4 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Psma1Q9R1P4 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Psma1Q9R1P4 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Psma1Q9R1P4 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Psma1Q9R1P4 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Psma1Q9R1P4 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Psma1Q9R1P4 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Psma1Q9R1P4 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Psma1Q9R1P4 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Psma1Q9R1P4 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Psma1Q9R1P4 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Psma1Q9R1P4 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Psma1Q9R1P4 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Psma1Q9R1P4 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Psma1Q9R1P4 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Psma1Q9R1P4 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Psma1Q9R1P4 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Psma1Q9R1P4 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Psma1Q9R1P4 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Psma1Q9R1P4 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Psma1Q9R1P4 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Psma1Q9R1P4 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Psma1Q9R1P4 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Psma1Q9R1P4 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Psma1Q9R1P4 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Psma1Q9R1P4 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Psma1Q9R1P4 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Psma1Q9R1P4 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Psma1Q9R1P4 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Psma1Q9R1P4 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Psma1Q9R1P4 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Psma1Q9R1P4 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Psma1Q9R1P4 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Psma1Q9R1P4 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Psma1Q9R1P4 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Psma1Q9R1P4 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Psma1Q9R1P4 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Psma1Q9R1P4 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Psma1Q9R1P4 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Psma1Q9R1P4 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Psma1Q9R1P4 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Psma1Q9R1P4 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms