Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E1

Plod3, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod3Q9R0E1 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Plod3Q9R0E1 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms