Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0C8

Vav3, Guanine nucleotide exchange factor VAV3, mousemouse

Predictions only

Length 847 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav3Q9R0C8 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vav3Q9R0C8 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vav3Q9R0C8 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vav3Q9R0C8 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vav3Q9R0C8 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vav3Q9R0C8 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vav3Q9R0C8 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vav3Q9R0C8 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vav3Q9R0C8 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vav3Q9R0C8 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vav3Q9R0C8 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Vav3Q9R0C8 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vav3Q9R0C8 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vav3Q9R0C8 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vav3Q9R0C8 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vav3Q9R0C8 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vav3Q9R0C8 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vav3Q9R0C8 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vav3Q9R0C8 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vav3Q9R0C8 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vav3Q9R0C8 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vav3Q9R0C8 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vav3Q9R0C8 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vav3Q9R0C8 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vav3Q9R0C8 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vav3Q9R0C8 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vav3Q9R0C8 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vav3Q9R0C8 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vav3Q9R0C8 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vav3Q9R0C8 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vav3Q9R0C8 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vav3Q9R0C8 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vav3Q9R0C8 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vav3Q9R0C8 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vav3Q9R0C8 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vav3Q9R0C8 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vav3Q9R0C8 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vav3Q9R0C8 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vav3Q9R0C8 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vav3Q9R0C8 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vav3Q9R0C8 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vav3Q9R0C8 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Vav3Q9R0C8 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vav3Q9R0C8 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vav3Q9R0C8 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vav3Q9R0C8 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vav3Q9R0C8 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vav3Q9R0C8 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vav3Q9R0C8 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vav3Q9R0C8 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vav3Q9R0C8 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vav3Q9R0C8 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vav3Q9R0C8 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vav3Q9R0C8 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vav3Q9R0C8 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vav3Q9R0C8 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vav3Q9R0C8 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vav3Q9R0C8 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vav3Q9R0C8 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vav3Q9R0C8 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vav3Q9R0C8 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vav3Q9R0C8 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vav3Q9R0C8 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vav3Q9R0C8 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vav3Q9R0C8 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vav3Q9R0C8 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vav3Q9R0C8 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Vav3Q9R0C8 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Vav3Q9R0C8 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vav3Q9R0C8 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vav3Q9R0C8 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vav3Q9R0C8 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vav3Q9R0C8 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vav3Q9R0C8 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vav3Q9R0C8 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vav3Q9R0C8 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vav3Q9R0C8 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vav3Q9R0C8 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vav3Q9R0C8 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vav3Q9R0C8 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vav3Q9R0C8 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Vav3Q9R0C8 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vav3Q9R0C8 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vav3Q9R0C8 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vav3Q9R0C8 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vav3Q9R0C8 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Vav3Q9R0C8 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vav3Q9R0C8 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vav3Q9R0C8 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vav3Q9R0C8 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vav3Q9R0C8 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vav3Q9R0C8 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vav3Q9R0C8 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vav3Q9R0C8 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vav3Q9R0C8 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Vav3Q9R0C8 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vav3Q9R0C8 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vav3Q9R0C8 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vav3Q9R0C8 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Vav3Q9R0C8 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms