Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ercc4Q9QZD4 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms