Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ28

Six6, Homeobox protein SIX6, mousemouse

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Length 246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six6Q9QZ28 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Six6Q9QZ28 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Six6Q9QZ28 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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