Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
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