Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME7

Trappc2l, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2lQ9JME7 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Trappc2lQ9JME7 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms