Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM58

Crlf1, Cytokine receptor-like factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf1Q9JM58 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Crlf1Q9JM58 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Crlf1Q9JM58 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Crlf1Q9JM58 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Crlf1Q9JM58 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Crlf1Q9JM58 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Crlf1Q9JM58 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Crlf1Q9JM58 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Crlf1Q9JM58 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Crlf1Q9JM58 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Crlf1Q9JM58 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Crlf1Q9JM58 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Crlf1Q9JM58 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Crlf1Q9JM58 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Crlf1Q9JM58 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Crlf1Q9JM58 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Crlf1Q9JM58 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Crlf1Q9JM58 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Crlf1Q9JM58 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Crlf1Q9JM58 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Crlf1Q9JM58 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Crlf1Q9JM58 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Crlf1Q9JM58 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Crlf1Q9JM58 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Crlf1Q9JM58 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Crlf1Q9JM58 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Crlf1Q9JM58 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Crlf1Q9JM58 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Crlf1Q9JM58 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Crlf1Q9JM58 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Crlf1Q9JM58 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Crlf1Q9JM58 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Crlf1Q9JM58 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Crlf1Q9JM58 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Crlf1Q9JM58 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Crlf1Q9JM58 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Crlf1Q9JM58 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Crlf1Q9JM58 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Crlf1Q9JM58 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Crlf1Q9JM58 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Crlf1Q9JM58 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Crlf1Q9JM58 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Crlf1Q9JM58 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Crlf1Q9JM58 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Crlf1Q9JM58 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Crlf1Q9JM58 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Crlf1Q9JM58 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Crlf1Q9JM58 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Crlf1Q9JM58 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Crlf1Q9JM58 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Crlf1Q9JM58 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Crlf1Q9JM58 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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