Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rabgef1Q9JM13 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms