Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gde1Q9JL56 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gde1Q9JL56 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gde1Q9JL56 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gde1Q9JL56 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gde1Q9JL56 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gde1Q9JL56 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gde1Q9JL56 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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Gde1Q9JL56 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gde1Q9JL56 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gde1Q9JL56 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gde1Q9JL56 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gde1Q9JL56 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gde1Q9JL56 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Gde1Q9JL56 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gde1Q9JL56 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gde1Q9JL56 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gde1Q9JL56 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Gde1Q9JL56 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gde1Q9JL56 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gde1Q9JL56 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Gde1Q9JL56 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gde1Q9JL56 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gde1Q9JL56 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gde1Q9JL56 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gde1Q9JL56 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gde1Q9JL56 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gde1Q9JL56 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gde1Q9JL56 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gde1Q9JL56 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gde1Q9JL56 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gde1Q9JL56 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gde1Q9JL56 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gde1Q9JL56 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gde1Q9JL56 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gde1Q9JL56 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gde1Q9JL56 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gde1Q9JL56 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gde1Q9JL56 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gde1Q9JL56 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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