Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms