Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIL2

Ccl28, C-C motif chemokine 28, mousemouse

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Length 130 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl28Q9JIL2 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl28Q9JIL2 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl28Q9JIL2 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl28Q9JIL2 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl28Q9JIL2 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl28Q9JIL2 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl28Q9JIL2 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl28Q9JIL2 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl28Q9JIL2 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl28Q9JIL2 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl28Q9JIL2 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl28Q9JIL2 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl28Q9JIL2 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl28Q9JIL2 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl28Q9JIL2 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl28Q9JIL2 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl28Q9JIL2 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl28Q9JIL2 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl28Q9JIL2 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl28Q9JIL2 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl28Q9JIL2 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl28Q9JIL2 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl28Q9JIL2 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl28Q9JIL2 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl28Q9JIL2 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl28Q9JIL2 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl28Q9JIL2 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl28Q9JIL2 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl28Q9JIL2 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl28Q9JIL2 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl28Q9JIL2 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl28Q9JIL2 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl28Q9JIL2 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl28Q9JIL2 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl28Q9JIL2 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl28Q9JIL2 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl28Q9JIL2 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl28Q9JIL2 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl28Q9JIL2 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl28Q9JIL2 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl28Q9JIL2 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl28Q9JIL2 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl28Q9JIL2 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl28Q9JIL2 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl28Q9JIL2 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl28Q9JIL2 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl28Q9JIL2 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl28Q9JIL2 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl28Q9JIL2 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccl28Q9JIL2 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccl28Q9JIL2 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccl28Q9JIL2 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccl28Q9JIL2 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccl28Q9JIL2 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccl28Q9JIL2 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccl28Q9JIL2 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccl28Q9JIL2 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccl28Q9JIL2 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccl28Q9JIL2 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccl28Q9JIL2 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccl28Q9JIL2 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccl28Q9JIL2 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccl28Q9JIL2 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccl28Q9JIL2 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccl28Q9JIL2 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccl28Q9JIL2 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Ccl28Q9JIL2 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccl28Q9JIL2 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccl28Q9JIL2 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Ccl28Q9JIL2 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccl28Q9JIL2 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccl28Q9JIL2 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccl28Q9JIL2 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccl28Q9JIL2 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccl28Q9JIL2 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccl28Q9JIL2 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccl28Q9JIL2 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccl28Q9JIL2 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccl28Q9JIL2 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccl28Q9JIL2 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccl28Q9JIL2 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccl28Q9JIL2 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccl28Q9JIL2 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccl28Q9JIL2 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccl28Q9JIL2 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccl28Q9JIL2 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccl28Q9JIL2 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccl28Q9JIL2 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccl28Q9JIL2 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccl28Q9JIL2 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccl28Q9JIL2 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccl28Q9JIL2 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccl28Q9JIL2 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccl28Q9JIL2 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccl28Q9JIL2 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccl28Q9JIL2 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccl28Q9JIL2 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccl28Q9JIL2 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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