Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESW8

Pgpep1, Pyroglutamyl-peptidase 1, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgpep1Q9ESW8 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Gm8872-201ENSMUST00000197475 1341 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Gm11893-201ENSMUST00000117829 491 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Gm12813-201ENSMUST00000119615 902 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Il2-201ENSMUST00000029275 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 BC028528-202ENSMUST00000090476 809 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Gm36943-201ENSMUST00000194422 282 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 9330118I20Rik-201ENSMUST00000203390 1066 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Pafah1b1-ps2-201ENSMUST00000207209 1223 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms