Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES64

Ush1c, Harmonin, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ush1cQ9ES64 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ush1cQ9ES64 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ush1cQ9ES64 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ush1cQ9ES64 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ush1cQ9ES64 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ush1cQ9ES64 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ush1cQ9ES64 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ush1cQ9ES64 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ush1cQ9ES64 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ush1cQ9ES64 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ush1cQ9ES64 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ush1cQ9ES64 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ush1cQ9ES64 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ush1cQ9ES64 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ush1cQ9ES64 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ush1cQ9ES64 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ush1cQ9ES64 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ush1cQ9ES64 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ush1cQ9ES64 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ush1cQ9ES64 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ush1cQ9ES64 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ush1cQ9ES64 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ush1cQ9ES64 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ush1cQ9ES64 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ush1cQ9ES64 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ush1cQ9ES64 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ush1cQ9ES64 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ush1cQ9ES64 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ush1cQ9ES64 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ush1cQ9ES64 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ush1cQ9ES64 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ush1cQ9ES64 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ush1cQ9ES64 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ush1cQ9ES64 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ush1cQ9ES64 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ush1cQ9ES64 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ush1cQ9ES64 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ush1cQ9ES64 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ush1cQ9ES64 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ush1cQ9ES64 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ush1cQ9ES64 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ush1cQ9ES64 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ush1cQ9ES64 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ush1cQ9ES64 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ush1cQ9ES64 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ush1cQ9ES64 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ush1cQ9ES64 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ush1cQ9ES64 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ush1cQ9ES64 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ush1cQ9ES64 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ush1cQ9ES64 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Ush1cQ9ES64 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ush1cQ9ES64 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ush1cQ9ES64 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ush1cQ9ES64 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ush1cQ9ES64 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ush1cQ9ES64 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ush1cQ9ES64 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ush1cQ9ES64 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ush1cQ9ES64 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ush1cQ9ES64 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ush1cQ9ES64 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ush1cQ9ES64 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ush1cQ9ES64 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ush1cQ9ES64 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ush1cQ9ES64 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ush1cQ9ES64 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ush1cQ9ES64 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ush1cQ9ES64 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ush1cQ9ES64 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ush1cQ9ES64 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ush1cQ9ES64 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ush1cQ9ES64 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ush1cQ9ES64 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ush1cQ9ES64 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ush1cQ9ES64 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ush1cQ9ES64 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ush1cQ9ES64 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ush1cQ9ES64 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ush1cQ9ES64 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ush1cQ9ES64 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ush1cQ9ES64 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ush1cQ9ES64 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ush1cQ9ES64 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ush1cQ9ES64 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ush1cQ9ES64 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ush1cQ9ES64 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ush1cQ9ES64 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ush1cQ9ES64 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ush1cQ9ES64 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ush1cQ9ES64 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ush1cQ9ES64 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ush1cQ9ES64 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ush1cQ9ES64 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ush1cQ9ES64 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ush1cQ9ES64 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ush1cQ9ES64 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ush1cQ9ES64 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ush1cQ9ES64 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ush1cQ9ES64 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms