Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp29Q9ES63 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp29Q9ES63 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp29Q9ES63 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp29Q9ES63 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp29Q9ES63 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp29Q9ES63 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp29Q9ES63 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp29Q9ES63 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp29Q9ES63 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp29Q9ES63 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp29Q9ES63 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp29Q9ES63 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp29Q9ES63 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp29Q9ES63 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp29Q9ES63 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp29Q9ES63 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp29Q9ES63 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp29Q9ES63 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp29Q9ES63 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp29Q9ES63 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp29Q9ES63 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp29Q9ES63 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp29Q9ES63 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp29Q9ES63 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp29Q9ES63 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp29Q9ES63 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp29Q9ES63 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp29Q9ES63 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Usp29Q9ES63 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Usp29Q9ES63 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp29Q9ES63 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp29Q9ES63 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp29Q9ES63 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp29Q9ES63 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Usp29Q9ES63 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp29Q9ES63 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp29Q9ES63 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp29Q9ES63 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp29Q9ES63 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp29Q9ES63 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Usp29Q9ES63 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp29Q9ES63 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp29Q9ES63 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp29Q9ES63 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp29Q9ES63 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp29Q9ES63 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp29Q9ES63 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp29Q9ES63 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp29Q9ES63 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Usp29Q9ES63 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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Usp29Q9ES63 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Usp29Q9ES63 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms