Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERP3

Trim54, Tripartite motif-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim54Q9ERP3 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim54Q9ERP3 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim54Q9ERP3 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim54Q9ERP3 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim54Q9ERP3 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim54Q9ERP3 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim54Q9ERP3 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim54Q9ERP3 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim54Q9ERP3 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim54Q9ERP3 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim54Q9ERP3 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim54Q9ERP3 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim54Q9ERP3 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim54Q9ERP3 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim54Q9ERP3 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim54Q9ERP3 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim54Q9ERP3 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim54Q9ERP3 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim54Q9ERP3 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim54Q9ERP3 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim54Q9ERP3 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim54Q9ERP3 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim54Q9ERP3 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim54Q9ERP3 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim54Q9ERP3 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim54Q9ERP3 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim54Q9ERP3 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim54Q9ERP3 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim54Q9ERP3 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim54Q9ERP3 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim54Q9ERP3 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim54Q9ERP3 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim54Q9ERP3 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim54Q9ERP3 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim54Q9ERP3 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim54Q9ERP3 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim54Q9ERP3 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim54Q9ERP3 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim54Q9ERP3 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim54Q9ERP3 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim54Q9ERP3 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim54Q9ERP3 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim54Q9ERP3 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim54Q9ERP3 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim54Q9ERP3 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim54Q9ERP3 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim54Q9ERP3 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim54Q9ERP3 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim54Q9ERP3 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim54Q9ERP3 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim54Q9ERP3 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim54Q9ERP3 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim54Q9ERP3 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim54Q9ERP3 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim54Q9ERP3 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim54Q9ERP3 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim54Q9ERP3 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim54Q9ERP3 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim54Q9ERP3 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim54Q9ERP3 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim54Q9ERP3 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim54Q9ERP3 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim54Q9ERP3 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim54Q9ERP3 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim54Q9ERP3 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim54Q9ERP3 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim54Q9ERP3 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim54Q9ERP3 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim54Q9ERP3 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim54Q9ERP3 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim54Q9ERP3 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim54Q9ERP3 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim54Q9ERP3 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim54Q9ERP3 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim54Q9ERP3 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim54Q9ERP3 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim54Q9ERP3 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim54Q9ERP3 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim54Q9ERP3 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim54Q9ERP3 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim54Q9ERP3 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim54Q9ERP3 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim54Q9ERP3 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim54Q9ERP3 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim54Q9ERP3 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim54Q9ERP3 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim54Q9ERP3 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim54Q9ERP3 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim54Q9ERP3 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim54Q9ERP3 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim54Q9ERP3 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim54Q9ERP3 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim54Q9ERP3 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim54Q9ERP3 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim54Q9ERP3 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim54Q9ERP3 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim54Q9ERP3 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim54Q9ERP3 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim54Q9ERP3 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim54Q9ERP3 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
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