Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERA0

Tfcp2, Alpha-globin transcription factor CP2, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfcp2Q9ERA0 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tfcp2Q9ERA0 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tfcp2Q9ERA0 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tfcp2Q9ERA0 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tfcp2Q9ERA0 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tfcp2Q9ERA0 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tfcp2Q9ERA0 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tfcp2Q9ERA0 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tfcp2Q9ERA0 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tfcp2Q9ERA0 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tfcp2Q9ERA0 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tfcp2Q9ERA0 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tfcp2Q9ERA0 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tfcp2Q9ERA0 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tfcp2Q9ERA0 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tfcp2Q9ERA0 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tfcp2Q9ERA0 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tfcp2Q9ERA0 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tfcp2Q9ERA0 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tfcp2Q9ERA0 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tfcp2Q9ERA0 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tfcp2Q9ERA0 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tfcp2Q9ERA0 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tfcp2Q9ERA0 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tfcp2Q9ERA0 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tfcp2Q9ERA0 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tfcp2Q9ERA0 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tfcp2Q9ERA0 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tfcp2Q9ERA0 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tfcp2Q9ERA0 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tfcp2Q9ERA0 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tfcp2Q9ERA0 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tfcp2Q9ERA0 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tfcp2Q9ERA0 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tfcp2Q9ERA0 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tfcp2Q9ERA0 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tfcp2Q9ERA0 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tfcp2Q9ERA0 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tfcp2Q9ERA0 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tfcp2Q9ERA0 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tfcp2Q9ERA0 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tfcp2Q9ERA0 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tfcp2Q9ERA0 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tfcp2Q9ERA0 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tfcp2Q9ERA0 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tfcp2Q9ERA0 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tfcp2Q9ERA0 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tfcp2Q9ERA0 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tfcp2Q9ERA0 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tfcp2Q9ERA0 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tfcp2Q9ERA0 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tfcp2Q9ERA0 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tfcp2Q9ERA0 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tfcp2Q9ERA0 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tfcp2Q9ERA0 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tfcp2Q9ERA0 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tfcp2Q9ERA0 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tfcp2Q9ERA0 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tfcp2Q9ERA0 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tfcp2Q9ERA0 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tfcp2Q9ERA0 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tfcp2Q9ERA0 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tfcp2Q9ERA0 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tfcp2Q9ERA0 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tfcp2Q9ERA0 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tfcp2Q9ERA0 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tfcp2Q9ERA0 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tfcp2Q9ERA0 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tfcp2Q9ERA0 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tfcp2Q9ERA0 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tfcp2Q9ERA0 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tfcp2Q9ERA0 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tfcp2Q9ERA0 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tfcp2Q9ERA0 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tfcp2Q9ERA0 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tfcp2Q9ERA0 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tfcp2Q9ERA0 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tfcp2Q9ERA0 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tfcp2Q9ERA0 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tfcp2Q9ERA0 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tfcp2Q9ERA0 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tfcp2Q9ERA0 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tfcp2Q9ERA0 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tfcp2Q9ERA0 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tfcp2Q9ERA0 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tfcp2Q9ERA0 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tfcp2Q9ERA0 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tfcp2Q9ERA0 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tfcp2Q9ERA0 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tfcp2Q9ERA0 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tfcp2Q9ERA0 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tfcp2Q9ERA0 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tfcp2Q9ERA0 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tfcp2Q9ERA0 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tfcp2Q9ERA0 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tfcp2Q9ERA0 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tfcp2Q9ERA0 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tfcp2Q9ERA0 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tfcp2Q9ERA0 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tfcp2Q9ERA0 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms