Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER63

Tnfrsf23, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 23, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf23Q9ER63 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.6 ms