Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCG9

Trmt112, Multifunctional methyltransferase subunit TRM112-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt112Q9DCG9 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms