Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnf6Q9DBU5 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnf6Q9DBU5 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnf6Q9DBU5 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnf6Q9DBU5 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnf6Q9DBU5 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnf6Q9DBU5 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnf6Q9DBU5 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnf6Q9DBU5 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnf6Q9DBU5 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnf6Q9DBU5 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnf6Q9DBU5 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnf6Q9DBU5 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnf6Q9DBU5 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnf6Q9DBU5 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnf6Q9DBU5 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnf6Q9DBU5 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnf6Q9DBU5 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnf6Q9DBU5 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnf6Q9DBU5 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnf6Q9DBU5 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnf6Q9DBU5 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnf6Q9DBU5 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf6Q9DBU5 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf6Q9DBU5 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf6Q9DBU5 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf6Q9DBU5 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf6Q9DBU5 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf6Q9DBU5 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms