Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAW9

Cnn3, Calponin-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn3Q9DAW9 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnn3Q9DAW9 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnn3Q9DAW9 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnn3Q9DAW9 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnn3Q9DAW9 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnn3Q9DAW9 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnn3Q9DAW9 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnn3Q9DAW9 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnn3Q9DAW9 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnn3Q9DAW9 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnn3Q9DAW9 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnn3Q9DAW9 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnn3Q9DAW9 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnn3Q9DAW9 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnn3Q9DAW9 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnn3Q9DAW9 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnn3Q9DAW9 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnn3Q9DAW9 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnn3Q9DAW9 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnn3Q9DAW9 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnn3Q9DAW9 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnn3Q9DAW9 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnn3Q9DAW9 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnn3Q9DAW9 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnn3Q9DAW9 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnn3Q9DAW9 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnn3Q9DAW9 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnn3Q9DAW9 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnn3Q9DAW9 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnn3Q9DAW9 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnn3Q9DAW9 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnn3Q9DAW9 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnn3Q9DAW9 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnn3Q9DAW9 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnn3Q9DAW9 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnn3Q9DAW9 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnn3Q9DAW9 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnn3Q9DAW9 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnn3Q9DAW9 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnn3Q9DAW9 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnn3Q9DAW9 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnn3Q9DAW9 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnn3Q9DAW9 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnn3Q9DAW9 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnn3Q9DAW9 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnn3Q9DAW9 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnn3Q9DAW9 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnn3Q9DAW9 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnn3Q9DAW9 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnn3Q9DAW9 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnn3Q9DAW9 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnn3Q9DAW9 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnn3Q9DAW9 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnn3Q9DAW9 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnn3Q9DAW9 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnn3Q9DAW9 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnn3Q9DAW9 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnn3Q9DAW9 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnn3Q9DAW9 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnn3Q9DAW9 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnn3Q9DAW9 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnn3Q9DAW9 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnn3Q9DAW9 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnn3Q9DAW9 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnn3Q9DAW9 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnn3Q9DAW9 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnn3Q9DAW9 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnn3Q9DAW9 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnn3Q9DAW9 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnn3Q9DAW9 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnn3Q9DAW9 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnn3Q9DAW9 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnn3Q9DAW9 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnn3Q9DAW9 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnn3Q9DAW9 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnn3Q9DAW9 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnn3Q9DAW9 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnn3Q9DAW9 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnn3Q9DAW9 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnn3Q9DAW9 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnn3Q9DAW9 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnn3Q9DAW9 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnn3Q9DAW9 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnn3Q9DAW9 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnn3Q9DAW9 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnn3Q9DAW9 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnn3Q9DAW9 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnn3Q9DAW9 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnn3Q9DAW9 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnn3Q9DAW9 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnn3Q9DAW9 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnn3Q9DAW9 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnn3Q9DAW9 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnn3Q9DAW9 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnn3Q9DAW9 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnn3Q9DAW9 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnn3Q9DAW9 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnn3Q9DAW9 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnn3Q9DAW9 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnn3Q9DAW9 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms