Protein–RNA interactions for Protein: Q9D906

Atg7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, mousemouse

Predictions only

Length 698 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg7Q9D906 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg7Q9D906 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg7Q9D906 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg7Q9D906 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg7Q9D906 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg7Q9D906 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg7Q9D906 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg7Q9D906 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg7Q9D906 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg7Q9D906 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg7Q9D906 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg7Q9D906 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg7Q9D906 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg7Q9D906 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg7Q9D906 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg7Q9D906 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg7Q9D906 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg7Q9D906 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg7Q9D906 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg7Q9D906 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg7Q9D906 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg7Q9D906 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg7Q9D906 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg7Q9D906 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg7Q9D906 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg7Q9D906 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg7Q9D906 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg7Q9D906 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg7Q9D906 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg7Q9D906 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg7Q9D906 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg7Q9D906 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg7Q9D906 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg7Q9D906 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg7Q9D906 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg7Q9D906 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg7Q9D906 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg7Q9D906 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg7Q9D906 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg7Q9D906 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg7Q9D906 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg7Q9D906 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg7Q9D906 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg7Q9D906 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg7Q9D906 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg7Q9D906 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg7Q9D906 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg7Q9D906 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg7Q9D906 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg7Q9D906 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg7Q9D906 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg7Q9D906 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg7Q9D906 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg7Q9D906 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg7Q9D906 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg7Q9D906 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg7Q9D906 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg7Q9D906 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg7Q9D906 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg7Q9D906 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg7Q9D906 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg7Q9D906 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg7Q9D906 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg7Q9D906 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg7Q9D906 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg7Q9D906 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg7Q9D906 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg7Q9D906 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg7Q9D906 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg7Q9D906 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg7Q9D906 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg7Q9D906 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg7Q9D906 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg7Q9D906 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg7Q9D906 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg7Q9D906 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg7Q9D906 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg7Q9D906 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg7Q9D906 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg7Q9D906 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg7Q9D906 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg7Q9D906 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg7Q9D906 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg7Q9D906 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg7Q9D906 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg7Q9D906 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg7Q9D906 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg7Q9D906 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg7Q9D906 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg7Q9D906 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg7Q9D906 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg7Q9D906 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg7Q9D906 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg7Q9D906 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg7Q9D906 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg7Q9D906 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg7Q9D906 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg7Q9D906 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg7Q9D906 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg7Q9D906 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms