Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8D0

Tnfrsf13c, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, mousemouse

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Length 175 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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