Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms