Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Nop56Q9D6Z1 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Nop56Q9D6Z1 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Nop56Q9D6Z1 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Nop56Q9D6Z1 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Nop56Q9D6Z1 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Nop56Q9D6Z1 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Nop56Q9D6Z1 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Nop56Q9D6Z1 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Nop56Q9D6Z1 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Nop56Q9D6Z1 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Nop56Q9D6Z1 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Nop56Q9D6Z1 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Nop56Q9D6Z1 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Nop56Q9D6Z1 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Nop56Q9D6Z1 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Nop56Q9D6Z1 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Nop56Q9D6Z1 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Nop56Q9D6Z1 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Nop56Q9D6Z1 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Nop56Q9D6Z1 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Nop56Q9D6Z1 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Nop56Q9D6Z1 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Nop56Q9D6Z1 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Nop56Q9D6Z1 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Nop56Q9D6Z1 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Nop56Q9D6Z1 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Nop56Q9D6Z1 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Nop56Q9D6Z1 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Nop56Q9D6Z1 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Nop56Q9D6Z1 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Nop56Q9D6Z1 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Nop56Q9D6Z1 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Nop56Q9D6Z1 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Nop56Q9D6Z1 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Nop56Q9D6Z1 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Nop56Q9D6Z1 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Nop56Q9D6Z1 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Nop56Q9D6Z1 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Nop56Q9D6Z1 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Nop56Q9D6Z1 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Nop56Q9D6Z1 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Nop56Q9D6Z1 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Nop56Q9D6Z1 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Nop56Q9D6Z1 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Nop56Q9D6Z1 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Nop56Q9D6Z1 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Nop56Q9D6Z1 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Nop56Q9D6Z1 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Nop56Q9D6Z1 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Nop56Q9D6Z1 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nop56Q9D6Z1 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nop56Q9D6Z1 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nop56Q9D6Z1 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nop56Q9D6Z1 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nop56Q9D6Z1 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nop56Q9D6Z1 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nop56Q9D6Z1 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nop56Q9D6Z1 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nop56Q9D6Z1 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nop56Q9D6Z1 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Nop56Q9D6Z1 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nop56Q9D6Z1 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nop56Q9D6Z1 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nop56Q9D6Z1 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nop56Q9D6Z1 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Nop56Q9D6Z1 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nop56Q9D6Z1 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Nop56Q9D6Z1 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Nop56Q9D6Z1 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Nop56Q9D6Z1 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Nop56Q9D6Z1 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Nop56Q9D6Z1 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Nop56Q9D6Z1 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nop56Q9D6Z1 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nop56Q9D6Z1 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nop56Q9D6Z1 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nop56Q9D6Z1 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Nop56Q9D6Z1 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nop56Q9D6Z1 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nop56Q9D6Z1 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nop56Q9D6Z1 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nop56Q9D6Z1 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Nop56Q9D6Z1 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nop56Q9D6Z1 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nop56Q9D6Z1 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nop56Q9D6Z1 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Nop56Q9D6Z1 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nop56Q9D6Z1 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nop56Q9D6Z1 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nop56Q9D6Z1 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nop56Q9D6Z1 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nop56Q9D6Z1 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nop56Q9D6Z1 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nop56Q9D6Z1 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Nop56Q9D6Z1 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nop56Q9D6Z1 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nop56Q9D6Z1 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nop56Q9D6Z1 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nop56Q9D6Z1 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms