Protein–RNA interactions for Protein: Q9D646

Krt34, Keratin, type I cuticular Ha4, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt34Q9D646 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt34Q9D646 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt34Q9D646 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt34Q9D646 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt34Q9D646 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt34Q9D646 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt34Q9D646 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.1 ms