Protein–RNA interactions for Protein: Q9D506

Gm3404, Predicted gene 3404, mousemouse

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Length 307 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3404Q9D506 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3404Q9D506 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3404Q9D506 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3404Q9D506 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3404Q9D506 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3404Q9D506 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3404Q9D506 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3404Q9D506 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3404Q9D506 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3404Q9D506 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3404Q9D506 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3404Q9D506 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3404Q9D506 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3404Q9D506 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3404Q9D506 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3404Q9D506 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3404Q9D506 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3404Q9D506 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3404Q9D506 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3404Q9D506 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3404Q9D506 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Gm3404Q9D506 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3404Q9D506 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3404Q9D506 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3404Q9D506 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3404Q9D506 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3404Q9D506 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3404Q9D506 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Gm3404Q9D506 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3404Q9D506 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3404Q9D506 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3404Q9D506 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3404Q9D506 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3404Q9D506 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3404Q9D506 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3404Q9D506 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3404Q9D506 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3404Q9D506 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3404Q9D506 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3404Q9D506 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3404Q9D506 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
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Gm3404Q9D506 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3404Q9D506 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Gm3404Q9D506 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3404Q9D506 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3404Q9D506 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3404Q9D506 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Gm3404Q9D506 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3404Q9D506 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Gm3404Q9D506 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Gm3404Q9D506 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Gm3404Q9D506 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3404Q9D506 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3404Q9D506 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3404Q9D506 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3404Q9D506 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Gm3404Q9D506 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3404Q9D506 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3404Q9D506 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3404Q9D506 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3404Q9D506 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3404Q9D506 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3404Q9D506 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3404Q9D506 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3404Q9D506 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3404Q9D506 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3404Q9D506 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3404Q9D506 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3404Q9D506 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3404Q9D506 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3404Q9D506 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3404Q9D506 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3404Q9D506 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3404Q9D506 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3404Q9D506 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3404Q9D506 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3404Q9D506 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3404Q9D506 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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