Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Z5

Prame, Preferentially-expressed antigen in melanoma, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrameQ9D4Z5 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PrameQ9D4Z5 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PrameQ9D4Z5 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PrameQ9D4Z5 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PrameQ9D4Z5 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PrameQ9D4Z5 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PrameQ9D4Z5 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PrameQ9D4Z5 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PrameQ9D4Z5 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PrameQ9D4Z5 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PrameQ9D4Z5 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PrameQ9D4Z5 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PrameQ9D4Z5 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PrameQ9D4Z5 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PrameQ9D4Z5 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PrameQ9D4Z5 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PrameQ9D4Z5 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PrameQ9D4Z5 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PrameQ9D4Z5 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PrameQ9D4Z5 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PrameQ9D4Z5 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PrameQ9D4Z5 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PrameQ9D4Z5 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PrameQ9D4Z5 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PrameQ9D4Z5 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PrameQ9D4Z5 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PrameQ9D4Z5 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PrameQ9D4Z5 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PrameQ9D4Z5 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PrameQ9D4Z5 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PrameQ9D4Z5 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PrameQ9D4Z5 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PrameQ9D4Z5 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PrameQ9D4Z5 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PrameQ9D4Z5 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PrameQ9D4Z5 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PrameQ9D4Z5 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PrameQ9D4Z5 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PrameQ9D4Z5 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PrameQ9D4Z5 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PrameQ9D4Z5 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PrameQ9D4Z5 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PrameQ9D4Z5 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrameQ9D4Z5 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrameQ9D4Z5 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrameQ9D4Z5 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PrameQ9D4Z5 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrameQ9D4Z5 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PrameQ9D4Z5 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrameQ9D4Z5 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrameQ9D4Z5 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrameQ9D4Z5 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrameQ9D4Z5 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrameQ9D4Z5 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrameQ9D4Z5 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrameQ9D4Z5 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PrameQ9D4Z5 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrameQ9D4Z5 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrameQ9D4Z5 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PrameQ9D4Z5 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrameQ9D4Z5 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrameQ9D4Z5 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrameQ9D4Z5 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrameQ9D4Z5 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrameQ9D4Z5 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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PrameQ9D4Z5 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrameQ9D4Z5 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrameQ9D4Z5 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrameQ9D4Z5 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrameQ9D4Z5 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrameQ9D4Z5 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrameQ9D4Z5 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrameQ9D4Z5 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrameQ9D4Z5 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrameQ9D4Z5 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrameQ9D4Z5 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PrameQ9D4Z5 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PrameQ9D4Z5 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PrameQ9D4Z5 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PrameQ9D4Z5 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PrameQ9D4Z5 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PrameQ9D4Z5 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PrameQ9D4Z5 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PrameQ9D4Z5 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PrameQ9D4Z5 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PrameQ9D4Z5 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PrameQ9D4Z5 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PrameQ9D4Z5 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PrameQ9D4Z5 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PrameQ9D4Z5 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PrameQ9D4Z5 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PrameQ9D4Z5 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PrameQ9D4Z5 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PrameQ9D4Z5 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PrameQ9D4Z5 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PrameQ9D4Z5 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PrameQ9D4Z5 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PrameQ9D4Z5 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PrameQ9D4Z5 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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