Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4K7

Ccdc105, Coiled-coil domain-containing protein 105, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc105Q9D4K7 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc105Q9D4K7 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc105Q9D4K7 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc105Q9D4K7 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc105Q9D4K7 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc105Q9D4K7 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc105Q9D4K7 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc105Q9D4K7 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc105Q9D4K7 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc105Q9D4K7 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc105Q9D4K7 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc105Q9D4K7 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc105Q9D4K7 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc105Q9D4K7 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc105Q9D4K7 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc105Q9D4K7 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc105Q9D4K7 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc105Q9D4K7 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc105Q9D4K7 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc105Q9D4K7 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc105Q9D4K7 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc105Q9D4K7 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc105Q9D4K7 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc105Q9D4K7 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc105Q9D4K7 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc105Q9D4K7 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc105Q9D4K7 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc105Q9D4K7 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc105Q9D4K7 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc105Q9D4K7 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc105Q9D4K7 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc105Q9D4K7 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc105Q9D4K7 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc105Q9D4K7 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc105Q9D4K7 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc105Q9D4K7 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc105Q9D4K7 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc105Q9D4K7 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc105Q9D4K7 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc105Q9D4K7 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc105Q9D4K7 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc105Q9D4K7 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc105Q9D4K7 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc105Q9D4K7 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc105Q9D4K7 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc105Q9D4K7 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc105Q9D4K7 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc105Q9D4K7 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc105Q9D4K7 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc105Q9D4K7 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc105Q9D4K7 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc105Q9D4K7 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc105Q9D4K7 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc105Q9D4K7 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc105Q9D4K7 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc105Q9D4K7 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc105Q9D4K7 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Ccdc105Q9D4K7 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc105Q9D4K7 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc105Q9D4K7 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc105Q9D4K7 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc105Q9D4K7 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc105Q9D4K7 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc105Q9D4K7 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc105Q9D4K7 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc105Q9D4K7 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc105Q9D4K7 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc105Q9D4K7 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc105Q9D4K7 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc105Q9D4K7 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc105Q9D4K7 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc105Q9D4K7 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc105Q9D4K7 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc105Q9D4K7 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc105Q9D4K7 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc105Q9D4K7 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc105Q9D4K7 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc105Q9D4K7 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc105Q9D4K7 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc105Q9D4K7 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc105Q9D4K7 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc105Q9D4K7 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc105Q9D4K7 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc105Q9D4K7 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc105Q9D4K7 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc105Q9D4K7 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc105Q9D4K7 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc105Q9D4K7 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc105Q9D4K7 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc105Q9D4K7 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc105Q9D4K7 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc105Q9D4K7 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc105Q9D4K7 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc105Q9D4K7 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc105Q9D4K7 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc105Q9D4K7 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc105Q9D4K7 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc105Q9D4K7 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc105Q9D4K7 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc105Q9D4K7 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms