Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H2

Gcc1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcc1Q9D4H2 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gcc1Q9D4H2 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gcc1Q9D4H2 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gcc1Q9D4H2 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Gcc1Q9D4H2 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gcc1Q9D4H2 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gcc1Q9D4H2 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gcc1Q9D4H2 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gcc1Q9D4H2 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gcc1Q9D4H2 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gcc1Q9D4H2 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gcc1Q9D4H2 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gcc1Q9D4H2 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gcc1Q9D4H2 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gcc1Q9D4H2 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gcc1Q9D4H2 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gcc1Q9D4H2 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gcc1Q9D4H2 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gcc1Q9D4H2 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gcc1Q9D4H2 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gcc1Q9D4H2 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gcc1Q9D4H2 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gcc1Q9D4H2 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gcc1Q9D4H2 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gcc1Q9D4H2 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gcc1Q9D4H2 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gcc1Q9D4H2 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gcc1Q9D4H2 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gcc1Q9D4H2 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gcc1Q9D4H2 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gcc1Q9D4H2 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gcc1Q9D4H2 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gcc1Q9D4H2 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gcc1Q9D4H2 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gcc1Q9D4H2 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gcc1Q9D4H2 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gcc1Q9D4H2 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gcc1Q9D4H2 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Gcc1Q9D4H2 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Gcc1Q9D4H2 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Gcc1Q9D4H2 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Gcc1Q9D4H2 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Gcc1Q9D4H2 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Gcc1Q9D4H2 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Gcc1Q9D4H2 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gcc1Q9D4H2 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gcc1Q9D4H2 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gcc1Q9D4H2 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gcc1Q9D4H2 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gcc1Q9D4H2 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gcc1Q9D4H2 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gcc1Q9D4H2 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Gcc1Q9D4H2 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gcc1Q9D4H2 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gcc1Q9D4H2 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gcc1Q9D4H2 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Gcc1Q9D4H2 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gcc1Q9D4H2 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gcc1Q9D4H2 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gcc1Q9D4H2 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gcc1Q9D4H2 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gcc1Q9D4H2 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gcc1Q9D4H2 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gcc1Q9D4H2 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gcc1Q9D4H2 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gcc1Q9D4H2 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gcc1Q9D4H2 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gcc1Q9D4H2 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gcc1Q9D4H2 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gcc1Q9D4H2 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gcc1Q9D4H2 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gcc1Q9D4H2 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gcc1Q9D4H2 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gcc1Q9D4H2 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gcc1Q9D4H2 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gcc1Q9D4H2 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gcc1Q9D4H2 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gcc1Q9D4H2 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gcc1Q9D4H2 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gcc1Q9D4H2 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gcc1Q9D4H2 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gcc1Q9D4H2 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Gcc1Q9D4H2 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gcc1Q9D4H2 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gcc1Q9D4H2 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Gcc1Q9D4H2 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gcc1Q9D4H2 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gcc1Q9D4H2 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gcc1Q9D4H2 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gcc1Q9D4H2 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gcc1Q9D4H2 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gcc1Q9D4H2 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gcc1Q9D4H2 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gcc1Q9D4H2 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gcc1Q9D4H2 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gcc1Q9D4H2 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gcc1Q9D4H2 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gcc1Q9D4H2 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gcc1Q9D4H2 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gcc1Q9D4H2 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms