Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C6

Lrp2bp, LRP2-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp2bpQ9D4C6 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrp2bpQ9D4C6 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrp2bpQ9D4C6 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrp2bpQ9D4C6 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrp2bpQ9D4C6 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrp2bpQ9D4C6 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrp2bpQ9D4C6 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrp2bpQ9D4C6 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrp2bpQ9D4C6 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrp2bpQ9D4C6 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrp2bpQ9D4C6 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrp2bpQ9D4C6 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrp2bpQ9D4C6 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrp2bpQ9D4C6 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrp2bpQ9D4C6 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrp2bpQ9D4C6 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrp2bpQ9D4C6 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrp2bpQ9D4C6 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrp2bpQ9D4C6 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrp2bpQ9D4C6 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrp2bpQ9D4C6 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrp2bpQ9D4C6 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrp2bpQ9D4C6 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrp2bpQ9D4C6 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrp2bpQ9D4C6 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrp2bpQ9D4C6 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrp2bpQ9D4C6 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrp2bpQ9D4C6 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrp2bpQ9D4C6 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrp2bpQ9D4C6 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrp2bpQ9D4C6 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrp2bpQ9D4C6 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrp2bpQ9D4C6 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrp2bpQ9D4C6 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrp2bpQ9D4C6 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrp2bpQ9D4C6 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrp2bpQ9D4C6 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrp2bpQ9D4C6 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrp2bpQ9D4C6 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrp2bpQ9D4C6 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrp2bpQ9D4C6 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrp2bpQ9D4C6 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrp2bpQ9D4C6 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrp2bpQ9D4C6 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrp2bpQ9D4C6 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrp2bpQ9D4C6 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrp2bpQ9D4C6 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrp2bpQ9D4C6 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrp2bpQ9D4C6 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrp2bpQ9D4C6 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrp2bpQ9D4C6 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrp2bpQ9D4C6 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrp2bpQ9D4C6 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrp2bpQ9D4C6 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrp2bpQ9D4C6 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrp2bpQ9D4C6 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrp2bpQ9D4C6 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrp2bpQ9D4C6 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrp2bpQ9D4C6 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrp2bpQ9D4C6 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrp2bpQ9D4C6 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrp2bpQ9D4C6 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrp2bpQ9D4C6 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrp2bpQ9D4C6 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrp2bpQ9D4C6 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrp2bpQ9D4C6 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrp2bpQ9D4C6 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrp2bpQ9D4C6 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrp2bpQ9D4C6 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrp2bpQ9D4C6 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrp2bpQ9D4C6 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrp2bpQ9D4C6 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrp2bpQ9D4C6 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrp2bpQ9D4C6 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrp2bpQ9D4C6 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrp2bpQ9D4C6 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrp2bpQ9D4C6 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrp2bpQ9D4C6 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrp2bpQ9D4C6 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrp2bpQ9D4C6 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrp2bpQ9D4C6 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrp2bpQ9D4C6 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrp2bpQ9D4C6 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrp2bpQ9D4C6 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrp2bpQ9D4C6 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrp2bpQ9D4C6 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrp2bpQ9D4C6 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrp2bpQ9D4C6 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrp2bpQ9D4C6 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrp2bpQ9D4C6 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrp2bpQ9D4C6 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lrp2bpQ9D4C6 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lrp2bpQ9D4C6 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lrp2bpQ9D4C6 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrp2bpQ9D4C6 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrp2bpQ9D4C6 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrp2bpQ9D4C6 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrp2bpQ9D4C6 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrp2bpQ9D4C6 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrp2bpQ9D4C6 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms