Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rufy3Q9D394 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rufy3Q9D394 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rufy3Q9D394 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rufy3Q9D394 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rufy3Q9D394 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rufy3Q9D394 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rufy3Q9D394 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rufy3Q9D394 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rufy3Q9D394 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rufy3Q9D394 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rufy3Q9D394 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rufy3Q9D394 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rufy3Q9D394 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rufy3Q9D394 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rufy3Q9D394 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rufy3Q9D394 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rufy3Q9D394 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rufy3Q9D394 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rufy3Q9D394 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rufy3Q9D394 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rufy3Q9D394 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rufy3Q9D394 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rufy3Q9D394 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rufy3Q9D394 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rufy3Q9D394 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rufy3Q9D394 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rufy3Q9D394 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rufy3Q9D394 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms