Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2P4

Urm1, Ubiquitin-related modifier 1, mousemouse

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Length 101 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urm1Q9D2P4 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Urm1Q9D2P4 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Urm1Q9D2P4 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Urm1Q9D2P4 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Urm1Q9D2P4 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Urm1Q9D2P4 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Urm1Q9D2P4 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Urm1Q9D2P4 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Urm1Q9D2P4 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Urm1Q9D2P4 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Urm1Q9D2P4 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Urm1Q9D2P4 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Urm1Q9D2P4 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Urm1Q9D2P4 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Urm1Q9D2P4 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Urm1Q9D2P4 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Urm1Q9D2P4 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Urm1Q9D2P4 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Urm1Q9D2P4 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Urm1Q9D2P4 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Urm1Q9D2P4 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Urm1Q9D2P4 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Urm1Q9D2P4 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Urm1Q9D2P4 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Urm1Q9D2P4 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Urm1Q9D2P4 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Urm1Q9D2P4 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Urm1Q9D2P4 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Urm1Q9D2P4 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Urm1Q9D2P4 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Urm1Q9D2P4 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Urm1Q9D2P4 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Urm1Q9D2P4 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Urm1Q9D2P4 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Urm1Q9D2P4 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Urm1Q9D2P4 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Urm1Q9D2P4 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Urm1Q9D2P4 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Urm1Q9D2P4 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Urm1Q9D2P4 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Urm1Q9D2P4 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Urm1Q9D2P4 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Urm1Q9D2P4 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Urm1Q9D2P4 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Urm1Q9D2P4 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Urm1Q9D2P4 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Urm1Q9D2P4 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Urm1Q9D2P4 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Urm1Q9D2P4 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Urm1Q9D2P4 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Urm1Q9D2P4 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Urm1Q9D2P4 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Urm1Q9D2P4 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Urm1Q9D2P4 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Urm1Q9D2P4 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Urm1Q9D2P4 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Urm1Q9D2P4 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Urm1Q9D2P4 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Urm1Q9D2P4 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Urm1Q9D2P4 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Urm1Q9D2P4 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Urm1Q9D2P4 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Urm1Q9D2P4 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Urm1Q9D2P4 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Urm1Q9D2P4 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Urm1Q9D2P4 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Urm1Q9D2P4 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Urm1Q9D2P4 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Urm1Q9D2P4 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Urm1Q9D2P4 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Urm1Q9D2P4 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Urm1Q9D2P4 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Urm1Q9D2P4 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Urm1Q9D2P4 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Urm1Q9D2P4 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Urm1Q9D2P4 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Urm1Q9D2P4 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Urm1Q9D2P4 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Urm1Q9D2P4 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Urm1Q9D2P4 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Urm1Q9D2P4 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Urm1Q9D2P4 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Urm1Q9D2P4 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Urm1Q9D2P4 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Urm1Q9D2P4 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Urm1Q9D2P4 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Urm1Q9D2P4 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Urm1Q9D2P4 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Urm1Q9D2P4 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Urm1Q9D2P4 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Urm1Q9D2P4 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Urm1Q9D2P4 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Urm1Q9D2P4 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Urm1Q9D2P4 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Urm1Q9D2P4 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Urm1Q9D2P4 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Urm1Q9D2P4 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Urm1Q9D2P4 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Urm1Q9D2P4 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Urm1Q9D2P4 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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