Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms