Protein–RNA interactions for Protein: Q9D226

Krtap5-3, Keratin-associated protein 5-3, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap5-3Q9D226 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krtap5-3Q9D226 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Krtap5-3Q9D226 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krtap5-3Q9D226 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Krtap5-3Q9D226 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krtap5-3Q9D226 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krtap5-3Q9D226 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krtap5-3Q9D226 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krtap5-3Q9D226 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Krtap5-3Q9D226 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krtap5-3Q9D226 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krtap5-3Q9D226 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krtap5-3Q9D226 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krtap5-3Q9D226 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krtap5-3Q9D226 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krtap5-3Q9D226 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krtap5-3Q9D226 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krtap5-3Q9D226 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krtap5-3Q9D226 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krtap5-3Q9D226 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krtap5-3Q9D226 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krtap5-3Q9D226 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krtap5-3Q9D226 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krtap5-3Q9D226 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krtap5-3Q9D226 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krtap5-3Q9D226 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krtap5-3Q9D226 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krtap5-3Q9D226 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krtap5-3Q9D226 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krtap5-3Q9D226 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Krtap5-3Q9D226 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krtap5-3Q9D226 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krtap5-3Q9D226 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krtap5-3Q9D226 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krtap5-3Q9D226 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krtap5-3Q9D226 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krtap5-3Q9D226 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krtap5-3Q9D226 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Krtap5-3Q9D226 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krtap5-3Q9D226 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krtap5-3Q9D226 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krtap5-3Q9D226 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krtap5-3Q9D226 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krtap5-3Q9D226 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krtap5-3Q9D226 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krtap5-3Q9D226 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krtap5-3Q9D226 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krtap5-3Q9D226 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krtap5-3Q9D226 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krtap5-3Q9D226 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krtap5-3Q9D226 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krtap5-3Q9D226 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krtap5-3Q9D226 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krtap5-3Q9D226 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krtap5-3Q9D226 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krtap5-3Q9D226 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krtap5-3Q9D226 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krtap5-3Q9D226 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krtap5-3Q9D226 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krtap5-3Q9D226 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krtap5-3Q9D226 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krtap5-3Q9D226 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krtap5-3Q9D226 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krtap5-3Q9D226 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krtap5-3Q9D226 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krtap5-3Q9D226 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krtap5-3Q9D226 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krtap5-3Q9D226 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krtap5-3Q9D226 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krtap5-3Q9D226 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krtap5-3Q9D226 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krtap5-3Q9D226 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krtap5-3Q9D226 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krtap5-3Q9D226 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krtap5-3Q9D226 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krtap5-3Q9D226 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krtap5-3Q9D226 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krtap5-3Q9D226 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krtap5-3Q9D226 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krtap5-3Q9D226 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krtap5-3Q9D226 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krtap5-3Q9D226 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krtap5-3Q9D226 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Krtap5-3Q9D226 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krtap5-3Q9D226 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krtap5-3Q9D226 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krtap5-3Q9D226 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krtap5-3Q9D226 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krtap5-3Q9D226 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krtap5-3Q9D226 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krtap5-3Q9D226 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krtap5-3Q9D226 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krtap5-3Q9D226 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Krtap5-3Q9D226 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krtap5-3Q9D226 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Krtap5-3Q9D226 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krtap5-3Q9D226 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Krtap5-3Q9D226 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Krtap5-3Q9D226 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krtap5-3Q9D226 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms