Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E6

Tbcb, Tubulin-folding cofactor B, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TbcbQ9D1E6 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TbcbQ9D1E6 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TbcbQ9D1E6 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TbcbQ9D1E6 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TbcbQ9D1E6 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TbcbQ9D1E6 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TbcbQ9D1E6 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TbcbQ9D1E6 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TbcbQ9D1E6 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TbcbQ9D1E6 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TbcbQ9D1E6 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TbcbQ9D1E6 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TbcbQ9D1E6 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TbcbQ9D1E6 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TbcbQ9D1E6 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TbcbQ9D1E6 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TbcbQ9D1E6 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TbcbQ9D1E6 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TbcbQ9D1E6 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TbcbQ9D1E6 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TbcbQ9D1E6 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TbcbQ9D1E6 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TbcbQ9D1E6 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TbcbQ9D1E6 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TbcbQ9D1E6 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TbcbQ9D1E6 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TbcbQ9D1E6 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TbcbQ9D1E6 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TbcbQ9D1E6 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TbcbQ9D1E6 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TbcbQ9D1E6 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TbcbQ9D1E6 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TbcbQ9D1E6 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TbcbQ9D1E6 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TbcbQ9D1E6 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TbcbQ9D1E6 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TbcbQ9D1E6 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TbcbQ9D1E6 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TbcbQ9D1E6 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TbcbQ9D1E6 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TbcbQ9D1E6 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TbcbQ9D1E6 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TbcbQ9D1E6 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TbcbQ9D1E6 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TbcbQ9D1E6 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TbcbQ9D1E6 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TbcbQ9D1E6 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TbcbQ9D1E6 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TbcbQ9D1E6 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TbcbQ9D1E6 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TbcbQ9D1E6 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TbcbQ9D1E6 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TbcbQ9D1E6 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TbcbQ9D1E6 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TbcbQ9D1E6 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TbcbQ9D1E6 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TbcbQ9D1E6 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TbcbQ9D1E6 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TbcbQ9D1E6 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TbcbQ9D1E6 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TbcbQ9D1E6 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TbcbQ9D1E6 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TbcbQ9D1E6 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TbcbQ9D1E6 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TbcbQ9D1E6 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TbcbQ9D1E6 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TbcbQ9D1E6 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TbcbQ9D1E6 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TbcbQ9D1E6 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TbcbQ9D1E6 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TbcbQ9D1E6 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TbcbQ9D1E6 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TbcbQ9D1E6 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TbcbQ9D1E6 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TbcbQ9D1E6 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TbcbQ9D1E6 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TbcbQ9D1E6 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TbcbQ9D1E6 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TbcbQ9D1E6 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TbcbQ9D1E6 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TbcbQ9D1E6 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TbcbQ9D1E6 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TbcbQ9D1E6 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TbcbQ9D1E6 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TbcbQ9D1E6 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TbcbQ9D1E6 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TbcbQ9D1E6 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TbcbQ9D1E6 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TbcbQ9D1E6 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TbcbQ9D1E6 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TbcbQ9D1E6 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TbcbQ9D1E6 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TbcbQ9D1E6 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TbcbQ9D1E6 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TbcbQ9D1E6 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TbcbQ9D1E6 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TbcbQ9D1E6 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TbcbQ9D1E6 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TbcbQ9D1E6 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TbcbQ9D1E6 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms