Protein–RNA interactions for Protein: Q9D114

Hddc3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc3Q9D114 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hddc3Q9D114 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Hddc3Q9D114 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hddc3Q9D114 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hddc3Q9D114 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Hddc3Q9D114 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hddc3Q9D114 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hddc3Q9D114 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hddc3Q9D114 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hddc3Q9D114 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hddc3Q9D114 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hddc3Q9D114 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hddc3Q9D114 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hddc3Q9D114 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hddc3Q9D114 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hddc3Q9D114 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hddc3Q9D114 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hddc3Q9D114 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hddc3Q9D114 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hddc3Q9D114 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hddc3Q9D114 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hddc3Q9D114 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hddc3Q9D114 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hddc3Q9D114 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hddc3Q9D114 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hddc3Q9D114 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Hddc3Q9D114 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Hddc3Q9D114 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hddc3Q9D114 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hddc3Q9D114 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hddc3Q9D114 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hddc3Q9D114 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Hddc3Q9D114 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Hddc3Q9D114 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hddc3Q9D114 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Hddc3Q9D114 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hddc3Q9D114 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hddc3Q9D114 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hddc3Q9D114 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Hddc3Q9D114 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hddc3Q9D114 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hddc3Q9D114 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hddc3Q9D114 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hddc3Q9D114 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hddc3Q9D114 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hddc3Q9D114 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hddc3Q9D114 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hddc3Q9D114 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hddc3Q9D114 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hddc3Q9D114 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hddc3Q9D114 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hddc3Q9D114 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hddc3Q9D114 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hddc3Q9D114 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hddc3Q9D114 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hddc3Q9D114 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hddc3Q9D114 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hddc3Q9D114 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hddc3Q9D114 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hddc3Q9D114 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hddc3Q9D114 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hddc3Q9D114 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Hddc3Q9D114 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hddc3Q9D114 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hddc3Q9D114 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hddc3Q9D114 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Hddc3Q9D114 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Hddc3Q9D114 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hddc3Q9D114 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hddc3Q9D114 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hddc3Q9D114 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hddc3Q9D114 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hddc3Q9D114 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hddc3Q9D114 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hddc3Q9D114 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hddc3Q9D114 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hddc3Q9D114 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hddc3Q9D114 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hddc3Q9D114 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hddc3Q9D114 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hddc3Q9D114 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hddc3Q9D114 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hddc3Q9D114 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hddc3Q9D114 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hddc3Q9D114 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hddc3Q9D114 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hddc3Q9D114 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hddc3Q9D114 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hddc3Q9D114 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hddc3Q9D114 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hddc3Q9D114 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hddc3Q9D114 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hddc3Q9D114 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hddc3Q9D114 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hddc3Q9D114 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hddc3Q9D114 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hddc3Q9D114 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hddc3Q9D114 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hddc3Q9D114 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hddc3Q9D114 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms