Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gtf2e1Q9D0D5 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gtf2e1Q9D0D5 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gtf2e1Q9D0D5 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gtf2e1Q9D0D5 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gtf2e1Q9D0D5 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gtf2e1Q9D0D5 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gtf2e1Q9D0D5 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gtf2e1Q9D0D5 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Gtf2e1Q9D0D5 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Gtf2e1Q9D0D5 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Gtf2e1Q9D0D5 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Gtf2e1Q9D0D5 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Gtf2e1Q9D0D5 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Gtf2e1Q9D0D5 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Gtf2e1Q9D0D5 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gtf2e1Q9D0D5 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gtf2e1Q9D0D5 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gtf2e1Q9D0D5 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gtf2e1Q9D0D5 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gtf2e1Q9D0D5 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gtf2e1Q9D0D5 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gtf2e1Q9D0D5 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gtf2e1Q9D0D5 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gtf2e1Q9D0D5 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gtf2e1Q9D0D5 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gtf2e1Q9D0D5 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gtf2e1Q9D0D5 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gtf2e1Q9D0D5 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gtf2e1Q9D0D5 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gtf2e1Q9D0D5 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gtf2e1Q9D0D5 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gtf2e1Q9D0D5 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gtf2e1Q9D0D5 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gtf2e1Q9D0D5 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gtf2e1Q9D0D5 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gtf2e1Q9D0D5 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Gtf2e1Q9D0D5 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Gtf2e1Q9D0D5 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Gtf2e1Q9D0D5 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gtf2e1Q9D0D5 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Gtf2e1Q9D0D5 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gtf2e1Q9D0D5 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gtf2e1Q9D0D5 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gtf2e1Q9D0D5 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gtf2e1Q9D0D5 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gtf2e1Q9D0D5 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gtf2e1Q9D0D5 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gtf2e1Q9D0D5 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gtf2e1Q9D0D5 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gtf2e1Q9D0D5 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gtf2e1Q9D0D5 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gtf2e1Q9D0D5 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gtf2e1Q9D0D5 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Gtf2e1Q9D0D5 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gtf2e1Q9D0D5 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gtf2e1Q9D0D5 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gtf2e1Q9D0D5 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gtf2e1Q9D0D5 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gtf2e1Q9D0D5 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gtf2e1Q9D0D5 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gtf2e1Q9D0D5 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gtf2e1Q9D0D5 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gtf2e1Q9D0D5 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gtf2e1Q9D0D5 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gtf2e1Q9D0D5 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gtf2e1Q9D0D5 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Gtf2e1Q9D0D5 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gtf2e1Q9D0D5 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gtf2e1Q9D0D5 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gtf2e1Q9D0D5 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Gtf2e1Q9D0D5 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gtf2e1Q9D0D5 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Gtf2e1Q9D0D5 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gtf2e1Q9D0D5 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Gtf2e1Q9D0D5 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gtf2e1Q9D0D5 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gtf2e1Q9D0D5 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gtf2e1Q9D0D5 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gtf2e1Q9D0D5 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gtf2e1Q9D0D5 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gtf2e1Q9D0D5 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gtf2e1Q9D0D5 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gtf2e1Q9D0D5 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gtf2e1Q9D0D5 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gtf2e1Q9D0D5 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gtf2e1Q9D0D5 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gtf2e1Q9D0D5 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gtf2e1Q9D0D5 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gtf2e1Q9D0D5 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gtf2e1Q9D0D5 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gtf2e1Q9D0D5 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gtf2e1Q9D0D5 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gtf2e1Q9D0D5 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gtf2e1Q9D0D5 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gtf2e1Q9D0D5 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms