Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZX0

Elp3, Elongator complex protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elp3Q9CZX0 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Elp3Q9CZX0 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Elp3Q9CZX0 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Elp3Q9CZX0 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Elp3Q9CZX0 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Elp3Q9CZX0 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Elp3Q9CZX0 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Elp3Q9CZX0 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Elp3Q9CZX0 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Elp3Q9CZX0 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Elp3Q9CZX0 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Elp3Q9CZX0 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Elp3Q9CZX0 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Elp3Q9CZX0 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Elp3Q9CZX0 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Elp3Q9CZX0 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Elp3Q9CZX0 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Elp3Q9CZX0 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Elp3Q9CZX0 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Elp3Q9CZX0 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Elp3Q9CZX0 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Elp3Q9CZX0 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Elp3Q9CZX0 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Elp3Q9CZX0 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Elp3Q9CZX0 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Elp3Q9CZX0 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Elp3Q9CZX0 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Elp3Q9CZX0 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Elp3Q9CZX0 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Elp3Q9CZX0 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Elp3Q9CZX0 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Elp3Q9CZX0 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Elp3Q9CZX0 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Elp3Q9CZX0 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Elp3Q9CZX0 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Elp3Q9CZX0 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Elp3Q9CZX0 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Elp3Q9CZX0 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Elp3Q9CZX0 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Elp3Q9CZX0 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Elp3Q9CZX0 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Elp3Q9CZX0 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Elp3Q9CZX0 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Elp3Q9CZX0 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Elp3Q9CZX0 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Elp3Q9CZX0 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Elp3Q9CZX0 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Elp3Q9CZX0 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Elp3Q9CZX0 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Elp3Q9CZX0 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Elp3Q9CZX0 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Elp3Q9CZX0 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Elp3Q9CZX0 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Elp3Q9CZX0 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Elp3Q9CZX0 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Elp3Q9CZX0 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Elp3Q9CZX0 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Elp3Q9CZX0 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Elp3Q9CZX0 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Elp3Q9CZX0 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Elp3Q9CZX0 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Elp3Q9CZX0 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Elp3Q9CZX0 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Elp3Q9CZX0 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Elp3Q9CZX0 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Elp3Q9CZX0 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Elp3Q9CZX0 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Elp3Q9CZX0 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Elp3Q9CZX0 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Elp3Q9CZX0 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Elp3Q9CZX0 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Elp3Q9CZX0 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Elp3Q9CZX0 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Elp3Q9CZX0 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Elp3Q9CZX0 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Elp3Q9CZX0 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Elp3Q9CZX0 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Elp3Q9CZX0 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Elp3Q9CZX0 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Elp3Q9CZX0 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Elp3Q9CZX0 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Elp3Q9CZX0 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Elp3Q9CZX0 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Elp3Q9CZX0 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Elp3Q9CZX0 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Elp3Q9CZX0 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Elp3Q9CZX0 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Elp3Q9CZX0 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Elp3Q9CZX0 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Elp3Q9CZX0 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Elp3Q9CZX0 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Elp3Q9CZX0 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Elp3Q9CZX0 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Elp3Q9CZX0 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Elp3Q9CZX0 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Elp3Q9CZX0 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Elp3Q9CZX0 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Elp3Q9CZX0 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Elp3Q9CZX0 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Elp3Q9CZX0 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms