Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY57

Chtop, Chromatin target of PRMT1 protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChtopQ9CY57 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 Efcab12-201ENSMUST00000032468 2551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 Timd2-202ENSMUST00000109225 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 Olfr464-205ENSMUST00000217112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ChtopQ9CY57 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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