Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE6

Xrcc3, DNA repair protein XRCC3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc3Q9CXE6 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms