Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rpusd4Q9CWX4 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms