Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV6

Prkrip1, PRKR-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkrip1Q9CWV6 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prkrip1Q9CWV6 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms